Η Αγία Άννα διοικητικά ανήκε πάντα στην Επαρχία Λιβαδειάς του Νομού Βοιωτίας.
Η Διοικητική της παρουσία ξεκινάει με την ίδρυση του Ελληνικού κράτους
Στον κατάλογο Δήμων και Κοινοτήτων πρωτοπαρουσιάζεται με την ονομασία Κούκουρα και ανήκε στον Δήμο Κορώνειας ,Στην επόμενη τροποποίηση εντάχτηκε μαζί με τον Δήμο Κορώνειας στον διευρυμένο Δήμο Πέτρας ,Με την διάλυση των Δήμων και την δημιουργία Κοινοτήτων καταγράφεται ως Κοινότητα Κούκουρα. Μετέπειτα μετονομάζεται σε Αγία Άννα , Με την δημιουργία του Καποδίστρια εντάσσεται στον Δήμο Κορώνειας , Με την δημιουργία του Καλλικράτη εντάσσεται μαζί με τον Δήμο Κορώνειας στον Καλλικρατικό Δήμο Λιβαδειάς.
Στα Διοικητικά της όρια ανήκουν και :
Ο οικισμός ‘’ Ζάλτσα ,, με επίσημη καταγραφή ως οικισμός στην απογραφή του 2001.
Η περιοχή ‘’Χειμαδιά των τριών πρώην κοινοτήτων: Κούκουρα, Στεβενίκο, Ζερίκι. και σημερινών Αγία Άννα ,Αγία Τριάδα ,Ελικώνας του Καλικρατικού Δήμου Λιβαδειάς.
Η Περιοχή ,,Ζάλτσα ‘’ που δραστηριοποιείται η Εταιρία: Delfi Club s.a
Η Μονή του Οσίου Σεραφείμ με τις καλλιεργήσιμες εκτάσεις που την περιβάλουν.
Εντός των Διοικητικών ορίων λειτουργούν πολλές επιχειρήσεις.
Οι εγκαταστάσεις Ανεμογεννητριών στις θέσεις , Τούμπα, Καραμούζι, Ράχη, με τον Υποσταθμό τους.
Οι Ανεμογεννήτριες στην Περιοχή ‘’Σταυρός’’
Οι Ιχθυοκαλλιέργειες κατά μήκος των ακτών του Κορινθιακού στις θέσεις Αγιά, και μικρή Αγιά.
Οι Λατομικές επιχειρήσεις στην ευρύτερη περιοχή Ζάλτσας.
Οι Λατομικές επιχειρήσεις στην περιοχή Χούνη.
Οι Μεταλλευτικές επιχειρήσεις Βωξίτη στην Δυτική πλευρά του Ελικώνα
Οι Γραμμές μεταφοράς Ηλεκτρικής ενέργειας από ΒΙΠΕ Θίσβης σε Υ/Σ Υψηλάντη.
Όλες αυτές οι δραστηριότητες επιφέρουν έσοδα στην κοινότητα μέσω του Δήμου Λιβαδειάς βάση του Νόμου που υποχρεώνει τις επιχειρήσεις να πληρώνουν ετήσια τέλη βάσει του όγκου και της ποσότητας της παραγωγής τους.
Εδώ θα πρέπει να σημειώσουμε ότι μπορεί να εισπράττει τέλη η τέως Κοινότητα Αγίας Άννας και νυν Δημοτική Κοινότητα Δήμου Λιβαδειάς, αλλά οι κάτοικοι είναι αντίθετοι με τις περισσότερες από αυτές τις δραστηριότητες τις οποίες επέβαλε η Κεντρική Εξουσία αναγκαστικά. Έκαναν και συνεχίζουν να κάνουν αγώνες εναντίων αυτών των δραστηριοτήτων που ξεφυτρώνουν ανεξέλεγκτα σε όλη την περιοχή χωρίς έναν κεντρικό σχεδιασμό, τις θεωρούν βλαπτικές για την ήπια τουριστική ανάπτυξη της περιοχής τους.